14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3557 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3557  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6668  hypothetical protein  73.53 
 
 		 69 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.297538  normal  0.224588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4361  hypothetical protein  68.12 
 
 		 69 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5755  hypothetical protein  69.84 
 
 		 97 aa  95.9  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1983  hypothetical protein  72.88 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7629  hypothetical protein  64.06 
 
 		 65 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6054  hypothetical protein  69.49 
 
 		 64 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0759  hypothetical protein  52.63 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3174  hypothetical protein  40.35 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1296  hypothetical protein  39.58 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00854163  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0766  YhjC  45.31 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3137  hypothetical protein  42.55 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0896468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5312  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.50435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3339  hypothetical protein  35.09 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>