48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4269 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  31.21 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  32.89 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  24.68 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  25.41 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  28.66 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  29.51 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  30.07 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  27.08 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  28.74 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  27.03 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  26.9 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  27.27 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  22.35 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  27.38 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  26.82 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  27.45 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  24.29 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  26.04 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  24.22 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  25.34 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  29.01 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  29.41 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  25.66 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  23.76 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  29.32 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  24.64 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  26.09 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  25.26 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  25.26 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  25.26 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  23.38 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2048  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.32 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.045391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  26.47 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  17.92 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  26.28 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  26.47 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  26.47 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  26.28 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  28.79 
 
 		 433 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  26.09 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  24.48 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  25.16 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  17.61 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>