24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4058 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3660  hypothetical protein  73.16 
 
 
427 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30987  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3564  hypothetical protein  73.63 
 
 
427 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0365103  normal  0.100331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3861  hypothetical protein  73.4 
 
 
427 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5048  hypothetical protein  74.58 
 
 
458 aa  666    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.319901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4058  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0106  hypothetical protein  76.01 
 
 
427 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2685  hypothetical protein  76.01 
 
 
427 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2834  hypothetical protein  75.77 
 
 
427 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1528  hypothetical protein  76.01 
 
 
427 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1249  hypothetical protein  76.01 
 
 
427 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0089  hypothetical protein  76.01 
 
 
427 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5406  hypothetical protein  73.4 
 
 
427 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4703  hypothetical protein  73.16 
 
 
458 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408696  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0515  hypothetical protein  88.25 
 
 
424 aa  767    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25002  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0397  hypothetical protein  74.76 
 
 
427 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2448  hypothetical protein  72.92 
 
 
458 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755524  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1083  hypothetical protein  75.77 
 
 
427 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.6 
 
 
468 aa  212  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0945  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.43 
 
 
444 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6047  hypothetical protein  41.18 
 
 
405 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  30.72 
 
 
476 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.25 
 
 
209 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.07 
 
 
188 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  34.21 
 
 
221 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>