More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2340 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2340  OsmC family protein  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.785611  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0089  OsmC-like protein  76.73 
 
 
171 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5254  OsmC-like protein  75.48 
 
 
171 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5605  OsmC family protein  75.48 
 
 
171 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5438  OsmC family protein  70.44 
 
 
181 aa  230  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2403  OsmC family protein  66.05 
 
 
166 aa  228  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.872634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5793  OsmC family protein  70 
 
 
166 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5576  OsmC family protein  69.38 
 
 
166 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4623  OsmC family protein  74.84 
 
 
171 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000658892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5789  OsmC family protein  62.35 
 
 
166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301431  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5560  OsmC family protein  64.38 
 
 
166 aa  203  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6409  OsmC family protein  64.2 
 
 
166 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1994  OsmC family protein  58.75 
 
 
171 aa  188  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  47.45 
 
 
141 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0469  peroxiredoxin, Ohr subfamily  44.19 
 
 
143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3591  OsmC-like protein  43.36 
 
 
141 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.572762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  43.75 
 
 
141 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  40.58 
 
 
140 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  45.65 
 
 
141 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  38.69 
 
 
141 aa  100  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  41.48 
 
 
142 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  41.18 
 
 
140 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  40.15 
 
 
140 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  42.65 
 
 
143 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3790  peroxiredoxin, Ohr subfamily  43.07 
 
 
145 aa  98.2  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  43.48 
 
 
141 aa  98.2  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  39.46 
 
 
140 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  39.46 
 
 
140 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  39.46 
 
 
140 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  40.41 
 
 
142 aa  97.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  42.65 
 
 
139 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  40.14 
 
 
142 aa  97.4  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  47.14 
 
 
140 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  42.75 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  42.07 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.34 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  42.75 
 
 
138 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  43.48 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  42.36 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2265  organic hydroperoxide resistance protein, putative  37.5 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  45.86 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  41.67 
 
 
149 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  42.22 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  45.99 
 
 
142 aa  95.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  38.93 
 
 
138 aa  94.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  42.55 
 
 
141 aa  94.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  38.93 
 
 
138 aa  94.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  40 
 
 
141 aa  94.7  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  40 
 
 
143 aa  94.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  43.88 
 
 
142 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  39.71 
 
 
140 aa  94.4  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2167  OsmC family protein  35.66 
 
 
136 aa  94.4  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335018  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  42.75 
 
 
142 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  42.75 
 
 
142 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  42.65 
 
 
139 aa  94  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  40 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  45.53 
 
 
140 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  42.97 
 
 
141 aa  93.6  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  42.65 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  37.96 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  37.86 
 
 
141 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  38.93 
 
 
141 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  42.03 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  42.65 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  42.45 
 
 
142 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7220  OsmC family protein  40.28 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  42.65 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  42.65 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  42.65 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  44.36 
 
 
140 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  41.91 
 
 
140 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  42.75 
 
 
141 aa  92.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  40.34 
 
 
137 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.86 
 
 
141 aa  92.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  41.91 
 
 
139 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.28 
 
 
140 aa  91.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1741  OsmC family protein  45.38 
 
 
139 aa  91.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  37.42 
 
 
138 aa  90.9  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  44.93 
 
 
140 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  44.93 
 
 
140 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2314  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  36.96 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  40.74 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  41.91 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5252  OsmC family protein  41.61 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  38.69 
 
 
142 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4884  OsmC-like protein  41.61 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  40.3 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  40.15 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4973  OsmC family protein  41.61 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  41.26 
 
 
141 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  39.57 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>