38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1616 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1616  putative transmembrane protein  100 
 
 
213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  91.55 
 
 
213 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  69.01 
 
 
240 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1780  hypothetical protein  66.67 
 
 
213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0332  hypothetical protein  66.2 
 
 
213 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1370  hypothetical protein  66.2 
 
 
213 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0966  hypothetical protein  66.2 
 
 
213 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0229  hypothetical protein  66.2 
 
 
213 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0413  hypothetical protein  66.2 
 
 
213 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1865  hypothetical protein  66.2 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.331271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1746  putative transmembrane protein  64.42 
 
 
219 aa  268  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4131  hypothetical protein  64.93 
 
 
284 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00913314  normal  0.176797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3954  hypothetical protein  63.51 
 
 
218 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4417  hypothetical protein  63.03 
 
 
218 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0610786  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1323  hypothetical protein  63.11 
 
 
221 aa  254  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3844  hypothetical protein  60.95 
 
 
218 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4524  hypothetical protein  60.48 
 
 
223 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5780  hypothetical protein  60.48 
 
 
231 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279837  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0765  hypothetical protein  50.53 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0243  hypothetical protein  50.99 
 
 
221 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7125  hypothetical protein  49.01 
 
 
224 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0353961  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5341  hypothetical protein  45.07 
 
 
211 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503759  normal  0.0287928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1855  hypothetical protein  36.31 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4135  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4253  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0895  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4345  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4363  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4455  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3985  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3975  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.892203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4311  hypothetical protein  18.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4087  hypothetical protein  18.06 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2920  hypothetical protein  18.18 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  21.74 
 
 
252 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1912  hypothetical protein  24.22 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0871  hypothetical protein  33.93 
 
 
183 aa  41.6  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000102728  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1038  hypothetical protein  30.39 
 
 
234 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>