55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7786 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7786    100 
 
 
952 bp  1887    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.619604  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4264  transposase IS4 family protein  78.77 
 
 
561 bp  159  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3754    84.38 
 
 
174 bp  81.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  86.59 
 
 
966 bp  75.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  83.64 
 
 
984 bp  75.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3753  putative transposase  82.91 
 
 
468 bp  73.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  86.84 
 
 
960 bp  71.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  86.84 
 
 
960 bp  71.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  93.18 
 
 
993 bp  63.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  85.53 
 
 
960 bp  63.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  94.87 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  94.74 
 
 
981 bp  60  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0428    94.74 
 
 
459 bp  60  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  96.97 
 
 
981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  92.68 
 
 
966 bp  58  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  96.97 
 
 
993 bp  58  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  96.97 
 
 
993 bp  58  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  96.97 
 
 
981 bp  58  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5898    92.11 
 
 
602 bp  52  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  92.11 
 
 
981 bp  52  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4820    90.24 
 
 
171 bp  50.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.963252  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  91.67 
 
 
984 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1014 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1014 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  90 
 
 
1050 bp  48.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  90 
 
 
981 bp  48.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  86.44 
 
 
963 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 
993 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>