23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6788 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6788    100 
 
 		 1313 bp  2603    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617764  normal  0.368676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  92.16 
 
 		 1320 bp  1780    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  90.76 
 
 		 1296 bp  149  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  81.36 
 
 		 1338 bp  89.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  81.36 
 
 		 1332 bp  89.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  81.36 
 
 		 1362 bp  89.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  81.36 
 
 		 1362 bp  89.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  81.36 
 
 		 1362 bp  89.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  81.36 
 
 		 1362 bp  89.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  81.36 
 
 		 1332 bp  89.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  85.57 
 
 		 1437 bp  81.8  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  83.84 
 
 		 1320 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  83.87 
 
 		 1293 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  81.25 
 
 		 1362 bp  63.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  81.25 
 
 		 1362 bp  63.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41850  transposase  81.25 
 
 		 606 bp  63.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  82.52 
 
 		 1284 bp  61.9  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  94.74 
 
 		 1410 bp  60  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00295  isrso17-transposase protein  84.72 
 
 		 960 bp  56  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00607053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2502    96.67 
 
 		 1273 bp  52  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4393    96.67 
 
 		 1240 bp  52  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 297 bp  50.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2598    96.43 
 
 		 1184 bp  48.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>