29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3414 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  100 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  40.71 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  40.38 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  41.36 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  35.56 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  34.85 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  31.83 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  30.58 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  31.34 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  32.13 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  35.75 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  34.36 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  36.65 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  32.31 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  32.16 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  33.97 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  30.82 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  34.25 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  35.38 
 
 		 374 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  34.26 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  33.18 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  32.14 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  26.88 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  27.07 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  29.73 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  32.95 
 
 		 136 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  25.48 
 
 		 336 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  27.17 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  23.08 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>