73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2733 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2733  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3534  protein of unknown function DUF1415  75.82 
 
 
194 aa  297  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3616  hypothetical protein  78.16 
 
 
283 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3604  hypothetical protein  78.16 
 
 
207 aa  293  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3629  hypothetical protein  78.16 
 
 
207 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1734  hypothetical protein  77.59 
 
 
207 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0032  hypothetical protein  77.59 
 
 
207 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3168  hypothetical protein  77.59 
 
 
207 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2809  hypothetical protein  77.59 
 
 
207 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0498  hypothetical protein  73.08 
 
 
190 aa  290  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2607  hypothetical protein  73.08 
 
 
190 aa  290  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0471  hypothetical protein  72.53 
 
 
190 aa  290  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2941  hypothetical protein  76.37 
 
 
247 aa  289  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3586  hypothetical protein  71.43 
 
 
203 aa  286  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0403  hypothetical protein  71.98 
 
 
203 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0424  hypothetical protein  72.43 
 
 
184 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0429  hypothetical protein  70.88 
 
 
190 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2899  hypothetical protein  69.23 
 
 
190 aa  276  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815835  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0870  hypothetical protein  70.79 
 
 
197 aa  268  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0351684  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2457  hypothetical protein  71.82 
 
 
196 aa  254  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2114  hypothetical protein  62.94 
 
 
183 aa  222  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5572  hypothetical protein  58.58 
 
 
206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1040  hypothetical protein  63.1 
 
 
201 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3518  hypothetical protein  57.8 
 
 
178 aa  214  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2963  hypothetical protein  58.05 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.351971  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1005  hypothetical protein  56.67 
 
 
211 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2929  hypothetical protein  58.1 
 
 
206 aa  206  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0480  hypothetical protein  52.33 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0544  hypothetical protein  52.33 
 
 
185 aa  195  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03086  hypothetical protein  54.12 
 
 
186 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1246  hypothetical protein  57.65 
 
 
182 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3491  protein of unknown function DUF1415  52.51 
 
 
188 aa  187  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0706  protein of unknown function DUF1415  56.73 
 
 
205 aa  185  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1149  protein of unknown function DUF1415  55 
 
 
191 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3336  protein of unknown function DUF1415  60.12 
 
 
208 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2989  protein of unknown function DUF1415  58.82 
 
 
249 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3054  hypothetical protein  60.61 
 
 
208 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2881  hypothetical protein  50.3 
 
 
183 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2224  protein of unknown function DUF1415  44.94 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1556  hypothetical protein  43.93 
 
 
183 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.996386  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0737  hypothetical protein  52.73 
 
 
187 aa  154  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003684  hypothetical protein  41.9 
 
 
190 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1226  hypothetical protein  42.26 
 
 
182 aa  150  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02137  hypothetical protein  41.07 
 
 
193 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1818  protein of unknown function DUF1415  44.64 
 
 
181 aa  148  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0209901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3140  hypothetical protein  40.68 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0840937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2220  hypothetical protein  41.81 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0293  hypothetical protein  44.58 
 
 
182 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2192  hypothetical protein  40.68 
 
 
183 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2030  hypothetical protein  41.42 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1157  hypothetical protein  43.29 
 
 
189 aa  130  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1393  hypothetical protein  40.8 
 
 
186 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0285397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1683  hypothetical protein  42.24 
 
 
191 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0614487  unclonable  0.00000199628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02963  hypothetical protein  38.95 
 
 
214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.058158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1492  hypothetical protein  37.85 
 
 
202 aa  124  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0122301  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1526  hypothetical protein  37.43 
 
 
182 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2825  protein of unknown function DUF1415  37.43 
 
 
182 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101254  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3180  hypothetical protein  38.15 
 
 
189 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.588963  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1559  hypothetical protein  36.87 
 
 
182 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1530  hypothetical protein  37.43 
 
 
182 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1715  hypothetical protein  36.87 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1428  hypothetical protein  36.87 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2756  hypothetical protein  37.65 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2743  hypothetical protein  37.43 
 
 
182 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0230588  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2635  hypothetical protein  36.87 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2568  hypothetical protein  36.87 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2979  hypothetical protein  37.79 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1845  hypothetical protein  39.74 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2233  hypothetical protein  35.06 
 
 
207 aa  111  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1353  hypothetical protein  35.47 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36742  predicted protein  33.33 
 
 
288 aa  96.3  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.905252  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45717  predicted protein  25.73 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33635  predicted protein  32.54 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728091  normal  0.688241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>