37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06170  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  684    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  38.21 
 
 
332 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6107  GCN5-related N-acetyltransferase  33.45 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0184  GCN5-related N-acetyltransferase  33.45 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.741033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
380 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0327579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
367 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6109  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17530  hypothetical protein  32.32 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal  0.317256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000116384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3532  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
336 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3785  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.63 
 
 
368 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0643958  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6111  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
337 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634814  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6110  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
338 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0914793  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5134  GCN5-related N-acetyltransferase  35.02 
 
 
337 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11760  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.65 
 
 
387 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0959824  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2703  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
376 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0753229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
332 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35570  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.99 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  31.64 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0668932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2992  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.723176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0150  GCN5-related N-acetyltransferase  32.13 
 
 
378 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20740  acetyltransferase (GNAT) family protein  27.74 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0325  hypothetical protein  34.09 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0137923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8300  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0361  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33440  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.04 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  27.49 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00168273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7043  hypothetical protein  34.78 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6223  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4645  acetyltransferase  34 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158798  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45347  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2026  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>