20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00650  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  226  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0757  protein of unknown function DUF718  67.65 
 
 
107 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6243  hypothetical protein  42.16 
 
 
104 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0571  protein of unknown function DUF718  37.86 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  34.62 
 
 
104 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0564  protein of unknown function DUF718  32.98 
 
 
101 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  29.13 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  29.13 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  32.38 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  32.35 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2208  L-rhamnose 1-epimerase  30.68 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09140  L-rhamnose 1-epimerase  32.99 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.435762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  27.84 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3872  protein of unknown function DUF718  32.22 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0310507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1033  hypothetical protein  26.92 
 
 
107 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.889586  normal  0.718477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3612  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0885  protein of unknown function DUF718  33.33 
 
 
118 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 
107 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  30.48 
 
 
104 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>