16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7511 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7511  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  70.21 
 
 
95 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01610  hypothetical protein  69.15 
 
 
95 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522727  normal  0.697897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4250  hypothetical protein  67.03 
 
 
94 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.41432  normal  0.497138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0412  hypothetical protein  67.02 
 
 
94 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1619  hypothetical protein  68.13 
 
 
99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  48.81 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  51.19 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  48.81 
 
 
95 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0685  cupin 2 domain-containing protein  46.59 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.419495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1128  hypothetical protein  46.67 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  45.24 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1491  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.32 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3900  cupin 2 domain-containing protein  42.05 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.487212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6852  hypothetical protein  47.89 
 
 
73 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.286237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2708  cupin 2 protein  43.37 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.479174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>