39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4920 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0772  hypothetical protein  87.21 
 
 
555 aa  909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal  0.0209356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4920  hypothetical protein  100 
 
 
555 aa  1079    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.186721  normal  0.0651204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3447  hypothetical protein  100 
 
 
555 aa  1079    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319087  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5367  hypothetical protein  97.3 
 
 
555 aa  1004    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0331655  normal  0.148887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5149  ankyrin  54.2 
 
 
589 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377523  normal  0.510979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0068  ankyrin  55.3 
 
 
534 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3874  ankyrin repeat-containing protein  32.77 
 
 
511 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.50205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1564  ankyrin  29.1 
 
 
577 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.991027  normal  0.0684375 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  27.15 
 
 
870 aa  70.5  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  27.72 
 
 
1585 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  36.46 
 
 
442 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 
1622 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05074  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
275 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.101697  normal  0.225282 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  25.72 
 
 
762 aa  52  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  29.59 
 
 
395 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  31.22 
 
 
1156 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4904  Ankyrin  30.47 
 
 
476 aa  50.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 
1021 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2372  ankyrin  36.14 
 
 
519 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  26.77 
 
 
321 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0261  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  25.84 
 
 
1061 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  28.44 
 
 
426 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  25.17 
 
 
472 aa  47.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  30.96 
 
 
216 aa  47.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3680  ankyrin  37.12 
 
 
251 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0048166  normal  0.286035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0883  Ankyrin  38.3 
 
 
494 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3905  Ankyrin  38.05 
 
 
1112 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  23.57 
 
 
431 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  25.56 
 
 
305 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  29.07 
 
 
1101 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  32.69 
 
 
178 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  23.72 
 
 
369 aa  44.3  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  29.06 
 
 
427 aa  43.9  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 
1977 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  29.23 
 
 
479 aa  43.9  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2223  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
215 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0436044  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  23.2 
 
 
345 aa  43.5  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  32.34 
 
 
395 aa  43.5  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>