19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3639 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3639  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 128 aa  241  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  51.49 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  48.04 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  48.48 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2419  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  35.4 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  33.04 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  37.04 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.04 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  32.77 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 166 aa  40  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>