32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0709 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
214 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  53.81 
 
 
209 aa  184  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  56.22 
 
 
215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  49.25 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  49.25 
 
 
220 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  53.62 
 
 
205 aa  157  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  32.32 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  30.68 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  31.17 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  33.94 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  28.65 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  33.33 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  30.11 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  39.74 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  27.94 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  39.53 
 
 
317 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  25.49 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  34.18 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  46.51 
 
 
324 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  37.04 
 
 
180 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  31.05 
 
 
309 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  30.99 
 
 
320 aa  48.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  30.99 
 
 
320 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  30.12 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  55.88 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  35.37 
 
 
313 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  52.5 
 
 
300 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  36.36 
 
 
292 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  50 
 
 
262 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  39.68 
 
 
275 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  41.46 
 
 
277 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>