23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4962 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4962  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000410502  normal  0.0158952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5515  hypothetical protein  88.61 
 
 		 79 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000658879  normal  0.233252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0007  hypothetical protein  77.78 
 
 		 73 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000132585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4545  hypothetical protein  78.87 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5168  hypothetical protein  78.87 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000181942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5691  hypothetical protein  78.87 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000220142  decreased coverage  0.000175008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2369  hypothetical protein  70.69 
 
 		 65 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3286  hypothetical protein  70.69 
 
 		 65 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000244624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1500  hypothetical protein  70.69 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315052  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1141  hypothetical protein  70.69 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000213136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3173  hypothetical protein  70.69 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0030247  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2407  hypothetical protein  70.69 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000581897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7016  hypothetical protein  65.45 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172189  hitchhiker  0.00191992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3151  hypothetical protein  48.94 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2736  hypothetical protein  46 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3715  hypothetical protein  40.91 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3392  putative transmembrane anti-sigma factor  40.38 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1604  hypothetical protein  32.26 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0317  hypothetical protein  27.87 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0035  hypothetical protein  40.38 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2536  hypothetical protein  42.55 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0178  hypothetical protein  36.36 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3621  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0680768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>