13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4053 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  41.16 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  42.96 
 
 		 427 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  30.44 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  32.05 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  29.18 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  24.01 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  26.03 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  24.92 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  21.65 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  23.81 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  23.58 
 
 		 293 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  23.96 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>