37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3954 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3954  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  426  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4417  hypothetical protein  97.25 
 
 		 218 aa  420  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0610786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1323  hypothetical protein  86.7 
 
 		 221 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4131  hypothetical protein  86.18 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00913314  normal  0.176797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3844  hypothetical protein  84.86 
 
 		 218 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786394  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5780  hypothetical protein  84.4 
 
 		 231 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4524  hypothetical protein  84.4 
 
 		 223 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1616  putative transmembrane protein  63.51 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  62.98 
 
 		 213 aa  257  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1746  putative transmembrane protein  61.5 
 
 		 219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  59.42 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0332  hypothetical protein  60.39 
 
 		 213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1780  hypothetical protein  60.39 
 
 		 213 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1370  hypothetical protein  59.9 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0966  hypothetical protein  59.9 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0413  hypothetical protein  59.9 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0229  hypothetical protein  59.9 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1865  hypothetical protein  59.9 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.331271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0765  hypothetical protein  49.23 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0243  hypothetical protein  43.78 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7125  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5341  hypothetical protein  43.68 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503759  normal  0.0287928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1855  hypothetical protein  29.13 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4345  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4363  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0895  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4253  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4455  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3985  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3975  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.892203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4135  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4311  hypothetical protein  19.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4087  hypothetical protein  18.24 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0192  hypothetical protein  27.42 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2920  hypothetical protein  18.13 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.55 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  25.14 
 
 		 234 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>