19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3517 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3517  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4000  hypothetical protein  97.95 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  0.295716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1938  hypothetical protein  75.86 
 
 		 145 aa  223  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228062  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4260  hypothetical protein  72.22 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4106  hypothetical protein  72.22 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3417  hypothetical protein  72.22 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4480  hypothetical protein  67.81 
 
 		 138 aa  201  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3646  hypothetical protein  33.57 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1251  putative signal peptide protein  46.94 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00518719  normal  0.758996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1190  putative signal peptide protein  45.92 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0908829  normal  0.0329477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1315  putative signal peptide protein  44.9 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2618  hypothetical protein  42.27 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1998  putative signal peptide protein  40.21 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1971  putative signal peptide protein  34.53 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238735  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2835  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4413  hypothetical protein  27.47 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.937751 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4546  hypothetical protein  27.47 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0051838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0225  hypothetical protein  28 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2662  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>