17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3481 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3481  hypothetical protein  100 
 
 
671 aa  1364    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.278924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  77.79 
 
 
852 aa  1076    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  47.34 
 
 
856 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  21.16 
 
 
853 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  20.44 
 
 
858 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  20.44 
 
 
858 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  26.19 
 
 
893 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2278  hypothetical protein  22.92 
 
 
631 aa  77  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.262759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  22.96 
 
 
880 aa  76.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  23.34 
 
 
875 aa  57.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  22.76 
 
 
947 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  22.76 
 
 
947 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  22.76 
 
 
947 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  25.86 
 
 
862 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  21.96 
 
 
953 aa  47.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  21.57 
 
 
870 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  23.66 
 
 
832 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>