21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2738 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2738  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6013  xylose isomerase-like TIM barrel  90.22 
 
 		 275 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2074  xylose isomerase-like TIM barrel  89.3 
 
 		 274 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2685  xylose isomerase domain-containing protein  89.3 
 
 		 274 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2714  xylose isomerase domain-containing protein  89.67 
 
 		 274 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0612  xylose isomerase domain-containing protein  80.8 
 
 		 275 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3284  xylose isomerase domain-containing protein  61.6 
 
 		 276 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00754219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1245  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  58.36 
 
 		 273 aa  318  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3270  AP endonuclease  56.16 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  56.16 
 
 		 276 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2926  xylose isomerase domain-containing protein  57.14 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  0.384731 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4269  xylose isomerase domain-containing protein  53.38 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.53 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.29 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50090  myo-inositol catabolism protein  54.31 
 
 		 280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1677  xylose isomerase domain-containing protein  51.69 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2319  xylose isomerase domain-containing protein  48.85 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.57 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4717  xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.43 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4665  xylose isomerase domain-containing protein  34.51 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  28.65 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>