90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5859 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6569  MlrC domain-containing protein  91.87 
 
 
492 aa  819    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0911835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6568  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  77.22 
 
 
496 aa  767    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102219  hitchhiker  0.00991258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5722  MlrC-like  92.54 
 
 
403 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2560  hypothetical protein  78.25 
 
 
496 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5859  MlrC domain-containing protein  100 
 
 
500 aa  996    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0807432  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6097  MlrC domain-containing protein  97.4 
 
 
500 aa  902    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1587  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  66.94 
 
 
490 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6086  MlrC domain-containing protein  92.59 
 
 
500 aa  862    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7545  hypothetical protein  90.76 
 
 
500 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3825  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  66.67 
 
 
492 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4481  hypothetical protein  64.26 
 
 
497 aa  626  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313264  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4902  MlrC domain protein  66.67 
 
 
492 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6029  MlrC domain-containing protein  62.53 
 
 
488 aa  611  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6012  MlrC domain-containing protein  88.17 
 
 
376 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3464  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  62.86 
 
 
488 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4756  MlrC domain-containing protein  63.27 
 
 
491 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4259  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  56.05 
 
 
494 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4266  MlrC domain-containing protein  51.61 
 
 
494 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0762  MlrC domain-containing protein  55.85 
 
 
495 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5513  hypothetical protein  47.78 
 
 
500 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142983  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6004  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  41.5 
 
 
498 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3774  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  37.72 
 
 
510 aa  281  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1221  MlrC-like protein  35.1 
 
 
515 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4364  MlrC domain-containing protein  33.8 
 
 
527 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1343  hypothetical protein  36.94 
 
 
503 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1322  MlrC-like  33.27 
 
 
502 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02129  hypothetical protein  35.35 
 
 
494 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1406  MlrC domain protein  34.02 
 
 
501 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2942  MlrC domain-containing protein  35.92 
 
 
511 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1296  MlrC C-terminus family protein  35.92 
 
 
502 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5259  hypothetical protein  35.71 
 
 
508 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  0.119677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0684  hypothetical protein  32.02 
 
 
491 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2255  MlrC C-terminus family protein  37.73 
 
 
525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1194  MlrC-like  34.29 
 
 
506 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3068  MlrC domain-containing protein  37.14 
 
 
511 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295091  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6696  MlrC domain-containing protein  36.4 
 
 
516 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380742  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3013  MlrC domain-containing protein  33.46 
 
 
515 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.784284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2627  MlrC domain-containing protein  34.39 
 
 
503 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6174  MlrC domain protein  34.58 
 
 
505 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7649  MlrC domain-containing protein  34.98 
 
 
498 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428726  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3815  MlrC-like  35.41 
 
 
500 aa  199  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4349  hypothetical protein  32.6 
 
 
488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0702  hypothetical protein  30.82 
 
 
489 aa  196  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0897  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.54 
 
 
490 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1369  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.49 
 
 
487 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3899  hypothetical protein  30.75 
 
 
489 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0752  hypothetical protein  30.42 
 
 
489 aa  191  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.256842  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6013  hypothetical protein  88.6 
 
 
143 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0874  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.67 
 
 
487 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3885  hypothetical protein  32.52 
 
 
498 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3711  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.54 
 
 
482 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21787  hitchhiker  0.00970232 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4633  hypothetical protein  31.05 
 
 
500 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0253146  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4155  MlrC domain-containing protein  31.91 
 
 
498 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.870407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1621  hypothetical protein  29.67 
 
 
491 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0947431  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1557  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.06 
 
 
483 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6252  hypothetical protein  32.43 
 
 
488 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.179737  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2751  hypothetical protein  29.52 
 
 
488 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00233785  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0397  MlrC-like  29.84 
 
 
499 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1868  hypothetical protein  30.12 
 
 
491 aa  176  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1929  MlrC domain-containing protein  31.49 
 
 
507 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1696  hypothetical protein  27.02 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1660  hypothetical protein  28.01 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3378  MlrC domain-containing protein  35.89 
 
 
515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0192331  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3571  Microcystin LR degradation protein MlrC  27.25 
 
 
488 aa  173  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3979  MlrC-like  30.6 
 
 
494 aa  173  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5087  hypothetical protein  29.38 
 
 
482 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00418234  normal  0.445331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1459  Microcystin LR degradation protein MlrC  31.49 
 
 
498 aa  170  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2977  MlrC domain-containing protein  33 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3102  MlrC domain-containing protein  33 
 
 
518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4101  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.33 
 
 
480 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1326  MlrC C-terminus family protein  33 
 
 
518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4654  MlrC domain-containing protein  29.09 
 
 
477 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  0.119732 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6625  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.69 
 
 
491 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0548728  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2285  MlrC C-terminus family protein  31.64 
 
 
512 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.887677  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6244  hypothetical protein  28.94 
 
 
434 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5682  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.18 
 
 
491 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3778  MlrC domain protein  26.4 
 
 
488 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4648  hypothetical protein  29.78 
 
 
497 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.0618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4334  MlrC domain-containing protein  30.32 
 
 
489 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67984  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5236  putative microcystin LR degradation protein MlrC  29.05 
 
 
519 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  hitchhiker  0.000000241769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4776  MlrC domain-containing protein  31.22 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76631  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3799  MlrC domain-containing protein  29.64 
 
 
499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1346  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.34 
 
 
523 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4051  Microcystin LR degradation protein MlrC  33.59 
 
 
524 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1428  hypothetical protein  29.15 
 
 
510 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0130  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.33 
 
 
524 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1258  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.31 
 
 
561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367829  normal  0.015953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1717  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.21 
 
 
482 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679786  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00790  hypothetical protein  29.55 
 
 
509 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3062  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.19 
 
 
500 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>