19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5692 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5692  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  26.72 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  29.31 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  26.67 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  23.77 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2753  limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.84 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2797  limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.84 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2783  limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.84 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3985  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.21 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174553  normal  0.332359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  25.4 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  25.4 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  25.4 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  25 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  25 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  25 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0306  hypothetical protein  32 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.396112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  25.55 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  24.04 
 
 		 149 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>