22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5426 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5426  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4879  hypothetical protein  96.86 
 
 		 159 aa  306  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288398  normal  0.359894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5305  hypothetical protein  89.94 
 
 		 159 aa  287  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5555  hypothetical protein  89.94 
 
 		 159 aa  287  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4717  hypothetical protein  89.94 
 
 		 159 aa  287  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0104  hypothetical protein  84.97 
 
 		 162 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3251  hypothetical protein  76.47 
 
 		 162 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0150  hypothetical protein  33.57 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7329  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737619 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6759  hypothetical protein  29.22 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7314  hypothetical protein  37.88 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.0516985 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7580  hypothetical protein  34.4 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0039  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0375  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1209  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1052  hypothetical protein  30.71 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6753  hypothetical protein  33.08 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.694812  normal  0.562952 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6891  hypothetical protein  33.58 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7514  hypothetical protein  32.2 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0891854  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7289  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.000171233 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0635  hypothetical protein  29.13 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0235  transcriptional regulator, fis family  28.83 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>