15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4782 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4782  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4256  hypothetical protein  99.13 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1737  hypothetical protein  80.58 
 
 		 222 aa  357  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2045  hypothetical protein  79.61 
 
 		 222 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0577  hypothetical protein  70.43 
 
 		 209 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2887  hypothetical protein  64.48 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0248177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2895  hypothetical protein  63.93 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2795  hypothetical protein  62.84 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2398  hypothetical protein  61.75 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  34.24 
 
 		 185 aa  99  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  27.53 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  30.69 
 
 		 435 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1011  hypothetical protein  26.37 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0361  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>