23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3610 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  96.53 
 
 		 144 aa  290  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  94.44 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  94.44 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  94.44 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  82.01 
 
 		 144 aa  245  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  79.17 
 
 		 144 aa  245  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  76.6 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  75.54 
 
 		 140 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  78.2 
 
 		 138 aa  225  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  77.86 
 
 		 141 aa  225  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  76.26 
 
 		 140 aa  223  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  75.54 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  68.15 
 
 		 151 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  69.12 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  42.28 
 
 		 191 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.23 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  36.5 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  37.82 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.85 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  39.68 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>