21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3178 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1866  hypothetical protein  92.66 
 
 		 668 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3178  hypothetical protein  100 
 
 		 628 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110039  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3158  hypothetical protein  92.96 
 
 		 689 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2740  hypothetical protein  92.66 
 
 		 668 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3121  hypothetical protein  92.39 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1438  hypothetical protein  77.22 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0908  hypothetical protein  95.71 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  33.97 
 
 		 667 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  33.7 
 
 		 828 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1860 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  32.44 
 
 		 913 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  32.3 
 
 		 991 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  27.74 
 
 		 2764 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  27.11 
 
 		 2491 aa  67.4  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  35.59 
 
 		 941 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3197  hypothetical protein  25.74 
 
 		 231 aa  50.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  21.24 
 
 		 674 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  27.34 
 
 		 2797 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  27.34 
 
 		 2797 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1188  hypothetical protein  25.33 
 
 		 635 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  27.34 
 
 		 2665 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>