20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2082 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  332  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  332  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  67.22 
 
 		 180 aa  234  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  40.74 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3980  hypothetical protein  30.99 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  30.41 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4307  hypothetical protein  31.82 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  29.05 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  39.62 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  31.62 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  38.66 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0207  hypothetical protein  30.84 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.143626  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1337  hypothetical protein  35.29 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797958  decreased coverage  0.0043989 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0796  hypothetical protein  26.47 
 
 		 120 aa  50.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5280  hypothetical protein  35.29 
 
 		 98 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.389019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  32.33 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  29.5 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6793  hypothetical protein  29.57 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  32.04 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>