22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0516 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0516    100 
 
 		 927 bp  1838    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0520    99.57 
 
 		 927 bp  1806    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    88 
 
 		 1092 bp  854    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  85.15 
 
 		 930 bp  731    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  85.15 
 
 		 930 bp  731    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  85.15 
 
 		 930 bp  731    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0465    82.77 
 
 		 926 bp  547  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7056    86.27 
 
 		 174 bp  137  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1497    87.5 
 
 		 2972 bp  71.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  80.82 
 
 		 702 bp  67.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  91.67 
 
 		 873 bp  63.9  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3070    91.49 
 
 		 691 bp  61.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 1182 bp  56  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 924 bp  56  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 930 bp  56  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  92.5 
 
 		 873 bp  56  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  92.5 
 
 		 873 bp  56  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  92.5 
 
 		 546 bp  56  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 939 bp  54  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  80.95 
 
 		 873 bp  50.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  80.95 
 
 		 873 bp  50.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2593    85.71 
 
 		 315 bp  48.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.790603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>