12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0025 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0025  transposase  100 
 
 
115 aa  236  6.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  36.08 
 
 
505 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  36.08 
 
 
505 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  27.17 
 
 
522 aa  47  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  27.17 
 
 
427 aa  47  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  28.18 
 
 
514 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  29.47 
 
 
512 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  29.47 
 
 
512 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  29.47 
 
 
512 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  29.17 
 
 
513 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  36.84 
 
 
533 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  46.34 
 
 
512 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>