14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7215 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1337    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  52.76 
 
 		 660 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  59.55 
 
 		 681 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  54.63 
 
 		 673 aa  641    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  49.31 
 
 		 658 aa  624  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  32.7 
 
 		 691 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  32.7 
 
 		 691 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  31.18 
 
 		 650 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  32.48 
 
 		 647 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  33.71 
 
 		 689 aa  293  9e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  32 
 
 		 646 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  26.68 
 
 		 830 aa  210  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  30.14 
 
 		 1204 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  23.67 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>