More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5974 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5974  putative transposase  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6597  normal  0.546785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  47.95 
 
 		 88 aa  76.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  46.58 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  46.38 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  46.38 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  43.48 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  46.58 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  45.21 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  44.93 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  44.93 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  46.58 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  42.47 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  42.47 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  42.47 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  42.47 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  42.47 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  42.47 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  42.03 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  42.47 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  42.47 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  42.47 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  42.47 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  47.14 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  43.84 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  43.84 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  43.84 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  43.84 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  42.03 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  42.03 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  42.03 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  43.84 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  34.31 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  34.31 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  39.73 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  34.31 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  35.62 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  40.58 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4865  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3300  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1943  transposase IS3/IS911 family protein  41.79 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1493  transposase IS3/IS911 family protein  41.79 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  39.73 
 
 		 492 aa  70.5  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1473  transposase IS3/IS911 family protein  41.79 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.679984  normal  0.0616512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  35.05 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1505  transposase IS3/IS911 family protein  41.79 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1117  transposase IS3/IS911 family protein  41.79 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  35.62 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  35.62 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1760  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110926  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2224  IS407A, transposase OrfA  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2529  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2565  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0089  transposase subfamily protein  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0511092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0122  hypothetical protein  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0297  IS407A, transposase OrfA  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000529534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0313  IS407A, transposase OrfA  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00217618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0782  IS407A, transposase OrfA  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2146  transposase subfamily protein  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55070  hypothetical protein  43.94 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760769  unclonable  1.2837699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  43.06 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4650  transposase IS3/IS911 family protein  40.28 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204613  normal  0.663628 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0963  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851827  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1346  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0451  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1648  IS407A, transposase OrfA  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1750  transposase subfamily protein  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.834954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2412  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1708  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0375  transposase  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3048  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3030  transposase  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2697  transposase  43.28 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0602  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2657  IS407A, transposase OrfA  44.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>