17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4866 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4866  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6567  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  58.06 
 
 		 93 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563627  normal  0.497658 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  50.59 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7215  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  49.44 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.132948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  47.73 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2013  CopG family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  39.29 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.65 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0780  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.62 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.052112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0893  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  38.3 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.548223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  40.91 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  30.95 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.93 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2871  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.73 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117146  normal  0.120105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.5 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>