36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4628 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4628  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  hitchhiker  0.00905511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2593  hypothetical protein  29.9 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110945  normal  0.12741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0626  acyltransferase  27.43 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2382  acyltransferase family protein  26.42 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0119  hypothetical protein  27.74 
 
 
383 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0158514  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  29.46 
 
 
390 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1867  acyltransferase-like protein  28.81 
 
 
397 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0282967  hitchhiker  0.0000000000000352917 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4209  acyltransferase  32.89 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2521  acyltransferase family protein  26.51 
 
 
354 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1572  acyltransferase 3  28.85 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.653564  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0104  hypothetical protein  26.43 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.402195  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3594  hypothetical protein  30.72 
 
 
390 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.602516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  23.41 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  26.57 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4669  acyltransferase 3  29.11 
 
 
485 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53122  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3723  hypothetical protein  31.27 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3457  acyltransferase 3  31.27 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0914284  normal  0.537431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  26.09 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  26.09 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  26.09 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  25.57 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  28.53 
 
 
528 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01696  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08520)  22.68 
 
 
547 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0457343  normal  0.0488755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  24.78 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  24.35 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  22.36 
 
 
369 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  28.89 
 
 
233 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11061  conserved hypothetical protein  20.5 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.101379  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  23.62 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1645  acyltransferase family protein  24.35 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.310248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1009  acyltransferase 3  25.45 
 
 
473 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0379524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  24.35 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3700  acyltransferase family protein  31.63 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0274715  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  25.81 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  30.73 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  30.28 
 
 
389 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>