146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0488 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0488  CvpA protein  100 
 
 		 155 aa  297  3e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.888997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  66.42 
 
 		 187 aa  173  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  50.74 
 
 		 192 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  50.74 
 
 		 192 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  45.83 
 
 		 214 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  46.15 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  41.78 
 
 		 199 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  43.06 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  42.36 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0561  colicin V production protein  49.26 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  42.54 
 
 		 234 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  39.73 
 
 		 208 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  41.1 
 
 		 210 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  41.1 
 
 		 213 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  40.28 
 
 		 208 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  39.73 
 
 		 211 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1043  Colicin V production protein  38.41 
 
 		 206 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1188  Colicin V production protein  38.41 
 
 		 208 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  39.58 
 
 		 204 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  37.5 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  39.04 
 
 		 197 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4408  Colicin V production protein  39.04 
 
 		 198 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  39.04 
 
 		 197 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  39.69 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  35.56 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4630  Colicin V production protein  37.96 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  39.66 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  32.86 
 
 		 203 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1711  colicin V production protein  32.86 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  33.1 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1785  colicin V production protein  30.08 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.170102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  37.01 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1206  colicin V production protein  30.28 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  31.72 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  34.13 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  29.69 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  33.33 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  29.69 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  29.69 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  28.68 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  28.57 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  28.82 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  28.46 
 
 		 182 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  30.77 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  29.69 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  30.77 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  28.77 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  31.72 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  30.77 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  30.77 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  30.77 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  31.03 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  29.32 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2130  putative colicin V production protein  29.11 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  31.03 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  31.03 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  31.03 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  32.46 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  27.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  27.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  27.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  27.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  27.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  27.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  27.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  27.14 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  30.07 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  27.74 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  28.35 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  27.33 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  33.91 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  29.63 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  28.95 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  32.43 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  29.71 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  27.2 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  26.4 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  30.7 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  35.24 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  27.2 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  25 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  22.3 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  31.58 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  28.28 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  28.28 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  30.77 
 
 		 248 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  29.6 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  30.43 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  30.43 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  28.06 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  27.2 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  27.2 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  26.67 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  26.36 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  25.19 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  34.23 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  28 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  30.95 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  28 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>