39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00514 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  100 
 
 
153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  98.04 
 
 
153 aa  304  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  304  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  95.42 
 
 
153 aa  298  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  95.42 
 
 
153 aa  275  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  75.16 
 
 
155 aa  230  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  72.26 
 
 
155 aa  214  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  72.26 
 
 
155 aa  214  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  69.23 
 
 
154 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  67.32 
 
 
157 aa  209  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  68.63 
 
 
155 aa  206  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  68.63 
 
 
155 aa  206  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  65.81 
 
 
155 aa  204  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  65.16 
 
 
155 aa  202  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  68.39 
 
 
155 aa  201  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  63.64 
 
 
164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  65.36 
 
 
155 aa  196  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  64.29 
 
 
166 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  65.54 
 
 
159 aa  189  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  91.75 
 
 
99 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  91.75 
 
 
99 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  57.24 
 
 
153 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  57.89 
 
 
145 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  56.58 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  57.79 
 
 
155 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  56.13 
 
 
155 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  54.61 
 
 
145 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  50.65 
 
 
155 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  55.26 
 
 
145 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  50 
 
 
156 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  43.75 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  44.37 
 
 
150 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  39.33 
 
 
152 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  48.48 
 
 
99 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  31.33 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01347  hypothetical protein  91.67 
 
 
36 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  31.17 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  31.17 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>