23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  533  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  36.29 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  28.66 
 
 
335 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  32.62 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  32.41 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  33.89 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  34.36 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  32.97 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  27.74 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  32.54 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  25.34 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  25.61 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  30.56 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  25.59 
 
 
329 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2211  hypothetical protein  25.5 
 
 
378 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  36.44 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  23.78 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  28.15 
 
 
407 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  34.25 
 
 
133 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  32.88 
 
 
133 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  22.73 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  26.76 
 
 
407 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>