27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  57.49 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18070  Ion channel  40.98 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00210304  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  33.9 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  30.92 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  32.5 
 
 		 271 aa  62  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  31.37 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  32.08 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  28.67 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  32.38 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  31.48 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  32.76 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  38.75 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  30.56 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  25.77 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  29.56 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  43.1 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  21.6 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  43.1 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  27.1 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  33.96 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  34.88 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  25.73 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  28.44 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  30.11 
 
 		 102 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>