57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  100 
 
 		 539 aa  1095    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  50.38 
 
 		 563 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.04 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.93 
 
 		 572 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  49.12 
 
 		 580 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  45.58 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  49.81 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  49.15 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  48.44 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  48.63 
 
 		 601 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  44.88 
 
 		 525 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  43.35 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  45.54 
 
 		 581 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  41.84 
 
 		 621 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  41.94 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 552 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  45.95 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  40.73 
 
 		 625 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.35 
 
 		 625 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 533 aa  332  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  41.59 
 
 		 625 aa  330  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 623 aa  326  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  37.87 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  36.83 
 
 		 580 aa  295  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  37.34 
 
 		 563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  39.12 
 
 		 559 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 559 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  35.94 
 
 		 601 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 565 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  34.9 
 
 		 594 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  33.7 
 
 		 576 aa  270  5e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.77 
 
 		 559 aa  269  8.999999999999999e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  35.13 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  35.13 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  35.13 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  35.13 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.68 
 
 		 584 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  32.1 
 
 		 600 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  32.51 
 
 		 626 aa  220  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.43 
 
 		 871 aa  134  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 541 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  26.86 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 506 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  27.98 
 
 		 530 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  28.63 
 
 		 556 aa  114  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 532 aa  77.8  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0808  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224492  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2168  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.67 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 4079 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.36 
 
 		 810 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 878 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 632 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 621 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>