22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  126  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  81.82 
 
 
69 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  81.82 
 
 
69 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  72.73 
 
 
67 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  71.21 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  71.21 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  71.21 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  66.67 
 
 
69 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  47.69 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3743  hypothetical protein  56.92 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  72.5 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  45.76 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  52.27 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  42.11 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  46.34 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3030  hypothetical protein  47.83 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.299577  normal  0.851885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  52.17 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0008  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1054  hypothetical protein  45.1 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2240  hypothetical protein  52.94 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1947  hypothetical protein  52.94 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>