19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5534 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5534  celB protein  100 
 
 		 758 aa  1538    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  38.72 
 
 		 813 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  38.58 
 
 		 817 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  38.25 
 
 		 773 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  26.58 
 
 		 858 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  27.11 
 
 		 766 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  30.45 
 
 		 843 aa  183  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  29.91 
 
 		 862 aa  178  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  28.37 
 
 		 875 aa  177  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  29.81 
 
 		 842 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  29.42 
 
 		 881 aa  160  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  29.42 
 
 		 880 aa  160  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  28.32 
 
 		 727 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  30.16 
 
 		 758 aa  74.3  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  31.3 
 
 		 725 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  31.3 
 
 		 725 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  24.42 
 
 		 767 aa  59.7  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  29.75 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0572  hypothetical protein  21.85 
 
 		 768 aa  55.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>