33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5530 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5530  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  797    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1036  hypothetical protein  33.24 
 
 		 407 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1182  hypothetical protein  27.96 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.331396  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0136  hypothetical protein  30.74 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0667  hypothetical protein  26.32 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0869947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1027  hypothetical protein  24.66 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4332  hypothetical protein  30.74 
 
 		 355 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  22.31 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1485  hypothetical protein  22.76 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.807311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0560  protein of unknown function DUF482  21.6 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0543  protein of unknown function DUF482  21.6 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  20.22 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4569  hypothetical protein  22.34 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  22.95 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  23.23 
 
 		 771 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  22.84 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  25 
 
 		 386 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6162  hypothetical protein  23.5 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  25.97 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  21.31 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3419  hypothetical protein  20.5 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.346607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  23.98 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  21.51 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3568  protein of unknown function DUF482  19.94 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.207559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  21.26 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  21.26 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  17.42 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  21.23 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3500  protein of unknown function DUF482  19.94 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  22.25 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  20.36 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  19.75 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0804  hypothetical protein  20.98 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>