90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5263 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5263  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  54.13 
 
 
117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509895  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3444  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  55.24 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  0.147499 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  55.24 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  56.19 
 
 
126 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0436833  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5076  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  48.65 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807035  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4611  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  48.65 
 
 
113 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0113493 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0505  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  57.8 
 
 
120 aa  116  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0440  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  57.8 
 
 
120 aa  116  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.214986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5151  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  48.15 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2811  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  52.73 
 
 
123 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.1 
 
 
130 aa  107  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2659  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.3 
 
 
119 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1284  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  48.74 
 
 
140 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1600  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  45.28 
 
 
118 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2440  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  46.46 
 
 
118 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  51.35 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3133  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  54.13 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.34 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0577  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.37 
 
 
122 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0035249  decreased coverage  0.0097103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4319  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.55 
 
 
115 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.32 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0452283  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3476  potassium efflux system protein PhaG  40.17 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1353  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.29 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177814  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0058  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37.38 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1848  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  41.58 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.657682  normal  0.0378656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3315  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.79 
 
 
120 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3515  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.6 
 
 
121 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0115782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3257  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.26 
 
 
126 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.325283  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2225  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.6 
 
 
121 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.25 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0898  Na+/H+ antiporter subunit  38.53 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.2 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3448  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.47 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3810  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.68 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.266236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4734  Na+/H+ antiporter subunit  40 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.1 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3720  Na+/H+ antiporter subunit  32.69 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3813  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.68 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.661331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.66 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1519  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.93 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00644946  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0492  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.77 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1586  Na+/H+ antiporter subunit  37.37 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0671  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.48 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.97 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3294  Na+/H+ antiporter subunit  47.62 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0153  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.13 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  53.33 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3904  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.9 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1683  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.6 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129006  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.64 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3734  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2479  Na+/H+ antiporter subunit  38.64 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.49642  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1381  Na+/H+ antiporter subunit  38.64 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40215  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.01 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0227  Na+/H+ antiporter subunit  30.69 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0138139  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2657  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.69 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0997  pH adaption potassium efflux system, PhaG subunit  30.69 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.05 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0702  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.814859  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0138  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  34.34 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14800  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.31 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.93 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108043  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.93 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2338  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.71 
 
 
129 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.755181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  27.84 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.73 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3537  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.65 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2283  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.55 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0946  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  28.92 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0965  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  28.92 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0808525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0499  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.02 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2715  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.36 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0864  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
127 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.74172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2861  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.94 
 
 
136 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100868  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0566  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.62 
 
 
119 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1639  Na+/H+ antiporter subunit  37.21 
 
 
116 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1278  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.33 
 
 
121 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0734  monovalent cation/proton antiporter  32.32 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850476  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1107  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.63 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.15 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.894704  normal  0.681404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1428  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.19 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1795  Na+/H+ antiporter subunit  30.53 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.257451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2522  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  28.1 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3142  Na+/H+ antiporter subunit  27.27 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2971  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.35 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12384 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0559  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  27.78 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.751126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2166  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.15 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0754  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.82 
 
 
131 aa  40  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0542751  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>