15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2954 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  33.22 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  28.99 
 
 		 285 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  32.99 
 
 		 274 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  28.99 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  27.27 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4693  hypothetical protein  25.85 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  28.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  27.35 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  27.21 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0884  hypothetical protein  28.62 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  28.16 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  28.99 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  26.86 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>