122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1324 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0895  hypothetical protein  69.13 
 
 		 160 aa  233  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1024  hypothetical protein  66.67 
 
 		 158 aa  233  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0627  hypothetical protein  72.48 
 
 		 155 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3505  hypothetical protein  62 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1955  hypothetical protein  60.67 
 
 		 169 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1151  hypothetical protein  59.33 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.706631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2074  hypothetical protein  56.67 
 
 		 170 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1661  protein of unknown function UPF0153  57.82 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1404  hypothetical protein  57.33 
 
 		 171 aa  193  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0898  hypothetical protein  56.94 
 
 		 153 aa  186  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1801  hypothetical protein  59.18 
 
 		 160 aa  186  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.348768  normal  0.297133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1790  hypothetical protein  59.15 
 
 		 170 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0377386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32930  hypothetical protein  60.43 
 
 		 149 aa  183  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1432  hypothetical protein  61.24 
 
 		 170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1626  hypothetical protein  55.63 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0937096 
 
 
-
 
NC_004310  BR1477  hypothetical protein  61.24 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1358  hypothetical protein  59.18 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3918  hypothetical protein  59.71 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.871403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1567  hypothetical protein  59.71 
 
 		 149 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1776  hypothetical protein  59.57 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.924435  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1691  hypothetical protein  59.69 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1114  hypothetical protein  57.24 
 
 		 204 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95528  normal  0.301999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3057  hypothetical protein  57.45 
 
 		 147 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4092  hypothetical protein  59.71 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0879  hypothetical protein  57.64 
 
 		 163 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47410  hypothetical protein  59.71 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0895733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0887  protein of unknown function UPF0153  57.64 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0721  protein of unknown function UPF0153  57.75 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3920  hypothetical protein  56.83 
 
 		 162 aa  174  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0286797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1392  hypothetical protein  58.27 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0431  hypothetical protein  56.25 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2819  hypothetical protein  58.87 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2070  hypothetical protein  59.71 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4587  hypothetical protein  55.71 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2409  hypothetical protein  52.38 
 
 		 206 aa  170  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4117  hypothetical protein  55.71 
 
 		 150 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1301  hypothetical protein  55 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3897  hypothetical protein  55 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0890  protein of unknown function UPF0153  54.55 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0929  hypothetical protein  54.55 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0865  protein of unknown function UPF0153  53.85 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3366  hypothetical protein  54.86 
 
 		 148 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1340  hypothetical protein  53.57 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1382  hypothetical protein  58.59 
 
 		 155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0978  hypothetical protein  55.8 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2072  hypothetical protein  53.15 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2303  hypothetical protein  55.07 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2928  conserved hypothetical protein UPF0153 family  54.29 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0597493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3663  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1927  hypothetical protein  49.3 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000323397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1463  hypothetical protein  51.77 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2197  hypothetical protein  55.8 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1740  hypothetical protein  47.89 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1608  hypothetical protein  51.75 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0917  hypothetical protein  50.34 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0453  protein of unknown function UPF0153  52.41 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.604994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2181  hypothetical protein  45.77 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.02228  hitchhiker  0.000186068 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2247  hypothetical protein  47.59 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100566  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0576  hypothetical protein  47.86 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000050037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2003  hypothetical protein  47.95 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.808992  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3355  hypothetical protein  52.67 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3515  hypothetical protein  42.24 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.529376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2379  hypothetical protein  47.59 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123307  normal  0.207331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2529  hypothetical protein  47.89 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1767  hypothetical protein  44.37 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000753323  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0521  hypothetical protein  52.08 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2170  hypothetical protein  46.9 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1632  hypothetical protein  45.07 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000957769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1074  hypothetical protein  43.97 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.056354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2000  hypothetical protein  46.58 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2516  hypothetical protein  47.89 
 
 		 146 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2368  hypothetical protein  46.58 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1667  hypothetical protein  45.89 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000235569  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2467  protein of unknown function UPF0153  45.89 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000723255  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002897  hypothetical protein  45.14 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1281  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1325  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2444  hypothetical protein  45.89 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000434719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1968  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000843778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1336  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000903587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1871  hypothetical protein  45.07 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00350248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2421  hypothetical protein  45.07 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0029814  hitchhiker  0.00169444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1898  hypothetical protein  45.07 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000382294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03078  hypothetical protein  45.14 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1905  hypothetical protein  45.07 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0367301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2441  hypothetical protein  47.18 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1950  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2010  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220539  normal  0.187397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1953  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0472193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1506  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2751  hypothetical protein  45.89 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361359  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2573  hypothetical protein  45.52 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1322  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1943  hypothetical protein  46.58 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000318483  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2239  hypothetical protein  46.58 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000027257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01156  hypothetical protein  45.21 
 
 		 148 aa  140  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000316712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01166  hypothetical protein  45.21 
 
 		 148 aa  140  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000198247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2798  hypothetical protein  40.88 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2117  hypothetical protein  45.89 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.707271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>