40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1112 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1112  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0290  phosphoserine phosphatase  34.02 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3550  phosphoserine phosphatase  35.71 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24420  phosphoserine phosphatase  34.02 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41830  phosphoserine phosphatase  35.24 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1758  phosphoserine phosphatase  36.08 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2281  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.57 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1446  phosphoserine phosphatase  34.36 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343477  normal  0.353206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2544  phosphoserine phosphatase  35.29 
 
 		 205 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.938573  hitchhiker  0.0000142825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2079  phosphoserine phosphatase  35.05 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22014  hitchhiker  0.00429675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3211  phosphoserine phosphatase  31.84 
 
 		 204 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3902  phosphoserine phosphatase  32.65 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1390  phosphoserine phosphatase  35.03 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0057  phosphoserine phosphatase  32.67 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3725  phosphoserine phosphatase  33.16 
 
 		 191 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1581  phosphoserine phosphatase  33.69 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.051516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0818  phosphoserine phosphatase  32.67 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2053  phosphoserine phosphatase  32.66 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1629  phosphoserine phosphatase  31.96 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0583  phosphoserine phosphatase  31.61 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1670  phosphoserine phosphatase  31.02 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.685249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1255  hypothetical protein  38.02 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  27.85 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  29.51 
 
 		 408 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  28.1 
 
 		 326 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  28.1 
 
 		 326 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  26.32 
 
 		 331 aa  45.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  27.92 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  27.21 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  29.05 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  29.05 
 
 		 404 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  31.41 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  26.55 
 
 		 411 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  27.45 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  27.4 
 
 		 326 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  28.49 
 
 		 400 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  27.56 
 
 		 330 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  29.8 
 
 		 348 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  25.85 
 
 		 406 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  27.71 
 
 		 330 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>