16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0865 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  333  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  58.6 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  53.55 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  41.46 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  34.97 
 
 		 166 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  37.42 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0866  hypothetical protein  31.52 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  32.67 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  31.41 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0281  hypothetical protein  27.27 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  30.16 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  26.83 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  24.22 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>