19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2339 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2339  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  236  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2370  transposase  93.81 
 
 
103 aa  187  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00301314  normal  0.336671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4916  hypothetical protein  51.09 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.362826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4835  hypothetical protein  51.09 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4258  hypothetical protein  51.09 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0779487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4147  hypothetical protein  51.09 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.205919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0873  hypothetical protein  51.09 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000393117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2061  hypothetical protein  51.09 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0242  transposase  51.09 
 
 
151 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000269989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2700  hypothetical protein  42.86 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  31.18 
 
 
355 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
332 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
332 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  33.33 
 
 
332 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  33.33 
 
 
332 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  33.33 
 
 
332 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  39.24 
 
 
391 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5220  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5057  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.601105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>