21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0579 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0579  hypothetical protein  100 
 
 
501 aa  1040    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1578  hypothetical protein  53.31 
 
 
497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2925  hypothetical protein  52.65 
 
 
495 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.665125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3194  hypothetical protein  52.65 
 
 
495 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1741  hypothetical protein  48.74 
 
 
508 aa  500  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.230988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2449  hypothetical protein  43.66 
 
 
528 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000077314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2357  hypothetical protein  44.87 
 
 
481 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  26.03 
 
 
515 aa  64.7  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  25.86 
 
 
911 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  26.19 
 
 
906 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  25.71 
 
 
906 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  25 
 
 
906 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  26.77 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  27.6 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  22.95 
 
 
1099 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  23.53 
 
 
383 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  26.38 
 
 
435 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  24.84 
 
 
439 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  24.84 
 
 
439 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  24.84 
 
 
439 aa  43.9  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  24.84 
 
 
439 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>