14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2570 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2566  MORN variant repeat protein  97.25 
 
 
471 aa  864    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000064854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2570  MORN variant repeat protein  100 
 
 
472 aa  929    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000227673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0669  hypothetical protein  34.97 
 
 
160 aa  63.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.504548  normal  0.942031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2333  hypothetical protein  33.57 
 
 
345 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  31.9 
 
 
354 aa  50.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  25.38 
 
 
722 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  25.38 
 
 
722 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  25.61 
 
 
722 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  25.08 
 
 
722 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  29.91 
 
 
178 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  25 
 
 
361 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  28.07 
 
 
454 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  27.4 
 
 
449 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  26.58 
 
 
720 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>